國際法典將“危害”定義為：會對食品產生潛在的健康危害的生物、化學或物理因素或狀態(tài)。

國際食品微生物規(guī)范委員會在危害的定義里將安全性和質量都包括進去。

食品中的危害從來源上可分為自源性和外源性。自源性危害是原料本身所固有的危害，如原料自身的腐敗、天然毒素及其生長環(huán)境中受到污染等等；外源性危害是指在加工過程中引入食品中的危害，包括從原料采購、運輸、加工直至貯存、銷售過程中引入食品中的危害。

1、生物性危害

生物的危害包括有害的細菌、病毒、寄生蟲。食品中的生物危害既有可能來自于原料，也有可能來自于食品的加工過程。

微生物種類繁多分布廣泛，被劃分成各種類型。食品中重要的微生物種類包括：酵母、霉菌、細菌、病毒和原生動物。一般而言，酵母、霉菌不引起食品中的生物危害（雖然某些霉菌產生有害的毒素――化學危害），只有細菌、病毒、原生動物能引起食品的生物危害，使食品不安全。

⑴細菌危害

細菌危害是指某些有害細菌在食品中存活時，可以通過活菌的攝入引起人體（通常是腸道）感染或預先在食品中產生的細菌毒素導致人類中毒。前者稱為食品感染，后者稱為食品中毒。由于細菌是活的生命體，需要營養(yǎng)、水、溫度以及空氣條件（需氧、厭氧或兼性），因此通過控制這些因素，就能有效地抑制、殺滅致病菌，從而把細菌危害預防、消除或減少到可接收水平――符合規(guī)定的衛(wèi)生標準，例如，控制溫度和時間是常用且可行的預防措施――低溫可抑制微生物生長；加熱可以殺滅微生物。

⑵寄生蟲和原生動物

寄生蟲是需要有寄主才能存活的生物，生活在寄主體表或其體內。世界上存在幾千種寄生蟲。只有約20%的寄生蟲能在食物或水中發(fā)現(xiàn)，所知的通過食品感染人類的不到100種。通過食物或水感染人類的寄生蟲有線蟲（Nematodes/round worms）、絳蟲（Cestodes/tape worms）、吸蟲（Trematodes/flukes）和原生動物。

大多數(shù)寄生蟲對人類無害，但是可能讓人感到不舒服。寄生蟲感染通常與生的或未煮熟的食品有關，因為徹底加熱食品可以殺死所有食品所帶的寄生蟲。在特定情況下，冷凍可以被用來殺死食品中的寄生蟲。然而，消費者生吃含有感染性寄生蟲的食品會造成危害。

2、化學性危害

化學污染可以發(fā)生在食品生產和加工的任何階段?；瘜W品，例如：農藥、獸藥和食品添加劑等適當?shù)?、有控制地使用是沒有危害的，然而一旦使用不當或過量就會對消費者形成危害。

3、物理性危害

物理的危害包括任何在食品中發(fā)現(xiàn)的不正常的有潛在危害的外來物。物理的危害是最常見的消費者投訴的問題。因為傷害立即發(fā)生或吃后不久發(fā)生，并且傷害的來源是經常容易確認的。

以下是在食品中能引起物理危害的材料及來源：

食品與金屬的接觸，特別是機器的切割和攪拌操作及使用中部件可能破裂或脫落的設備，如金屬網眼皮帶，都可使金屬碎片進入產品。此類碎片對消費者構成危害。物理危害可通過對產品采用金屬探測裝置或經常檢查可能損壞的設備部位來予以控制。